Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MBD4O95243 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD4O95243 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD4O95243 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD4O95243 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD4O95243 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD4O95243 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD4O95243 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms