Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL18O94889 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL18O94889 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms