Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFL1O94874 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UFL1O94874 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms