Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPLO60437 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPLO60437 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPLO60437 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PPLO60437 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPLO60437 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPLO60437 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPLO60437 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPLO60437 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms