Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KALRNO60229 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KALRNO60229 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KALRNO60229 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms