Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX5O60225 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX5O60225 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms