Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms