Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNQ2O43526 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms