Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SGSM2O43147 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms