Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM6AO15550 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM6AO15550 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms