Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms