Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CDO00329 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CDO00329 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CDO00329 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CDO00329 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CDO00329 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CDO00329 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CDO00329 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CDO00329 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms