Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EIF3FO00303 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EIF3FO00303 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms