Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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