Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HNRNPCL3B7ZW38 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms