Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP17L5A8MUK1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms