Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NL46 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NL46 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NL46 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NL46 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NL46 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NL46 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NL46 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NL46 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NL46 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms