Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF316A6NFI3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms