Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms