Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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