Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms