Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms