Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPV2Q9Y5S1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPV2Q9Y5S1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms