Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUDCQ9Y266 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms