Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC11AQ9Y240 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC11AQ9Y240 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms