Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT8

ZC3H4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H4Q9UPT8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H4Q9UPT8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms