Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SETD1BQ9UPS6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms