Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms