Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms