Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80Q9ULG1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80Q9ULG1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms