Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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RAB23Q9ULC3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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RAB23Q9ULC3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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RAB23Q9ULC3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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