Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PARP4Q9UKK3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms