Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms