Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms