Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPA4Q9UI42 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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