Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms