Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SFMBT1Q9UHJ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SFMBT1Q9UHJ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms