Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms