Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms