Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms