Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms