Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms