Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRP2BPQ9P2M1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP2BPQ9P2M1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms