Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP36Q9P275 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP36Q9P275 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms