Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms