Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms