Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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TMOD3Q9NYL9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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