Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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