Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms