Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms